Cody Banks (Frankie Muniz) es un agente secreto de la CIA que vive la mayor parte del tiempo como un adolescente normal de quince años Los otros agentes hacen las labores de su casa, mientras que él se dedica a cumplir su misión. Es pésimo con las chicas y todos en la escuela lo ridiculizan, pero cuando una hermosa agente, Ronica Miles (Angie Harmon), entrenadora de la CIA, aparece en su escuela para llevárselo en una peligrosa misión, la vida de Cody cambia para siempre. Ahora debe no solo conquistar a una hermosa chica, Natalie Connors (Hilary Duff), sino evitar que un malvado millonario utilice una plaga de nanobots asesinos para la dominación global del mundo